Tahun 2016, setelah sepuluh tahun usia MTs. Terpadu Roudlotul Quran (Master RQ), dengan niatan bisa lebih mengistikomahkan pembinaan ilmu dan akhlak anak-anak, lebih mengokohkan iman santri serta misi menuntut ilmu setinggi-tingginya, maka berdiri MA. Sains Roudlotul Quran (MASA RQ). Dipilihnya bidang Sains agar siswa lebih mudah dalam mengakses pendidikan selanjutnya. Dengan modal dasar siswa-siswi kelas 9 MASTER RQ yang alhamdulillah siswa yang baik secara akhlak dan akademis menjadi putra sulung MASA RQ.
Berbagai prestasi telah diraih siswa MASA RQ sejak awal berdiri hingga sekarang baik prestasi bidang akademik maupun non akademik, diantaranya prestasi dalam kompetensi bergengsi seperti Kompetisi Sains Madrasah Tingkat Kabupaten hingga Provinsi, Olimpiade Tingkat Kabupaten hingga Nasional, Lomba Karya Tulis Ilmiah tingkat Kabupaten hingga se-Asia Tenggara, Pekan Olahraga dan Seni Tingkat Kabupaten, Lomba Membaca Kitab Kuning, Lomba PMR Tingkat Provinsi, Lomba Kepramukaan Tingkat Provinsi dan Lomba Qiroah Tingkat Nasional
Salah satu target utama lulusan MASA RQ adalah mampu bersaing dengan sekolah/madrasah favorit lainnya dan lulus berbagai jalur seleksi masuk Perguruan Tinggi Favorit di Indonesia. Dengan program unggulan Bimbingan Kelas Intensif dan Kelas Reguler UTBK, Tahun 2021 lulusan MASA RQ berhasil meraih total 80% siswa yang lolos dalam penjaringan masuk ke perguruan tinggi negeri. Sejak pertama kali meluluskan siswa tahun 2018 hingga sekarang, MASA RQ telah berhasil mengantarkan siswa-siswanya lulus seleksi masuk ke beberapa perguruan tinggi favorit seperti Universitas Airlangga, Universitas Negeri Surabaya, Universitas Negeri Malang, Universitas Brawijaya, Universitas Negeri Jember, Universitas Trunojoyo, Politeknik Perkapalan Negeri Surabaya, Politeknik Elektronika Negeri Surabaya, Politeknik Pembangunan Pertanian, Politeknik Negeri Madura, Politeknik Akademi Teknologi Kulit Yogyakarta dan berbagai Universitas Negeri Islam lainnya.
Harapan ke depan dari lembaga adalah mampu selalu mengantarkan siswa dan siswi MASA RQ menjadi lulusan yang siap berkompetensi dan berdaya saing dalam melanjutkan ke jenjang Perguruan Tinggi Negeri maupun Kampus favorit lain dengan tetap membawa akhlakul karimah serta dapat mengamalkan ilmu ke masyarakat luas.